연합뉴스에 따르면 정부 관계자는 "이날 판문점에서 양측 연락관이 만났으며, 이 자리에서 우리측 연락관이 노무현 대통령과 정세현 통일부 장관의 유감표명을 전했으며, 북측도 상부와의 연락을 통해 `이제 문제가 다 풀렸다'는 입장을 밝혔다"고 전했다.
한편 노 대통령은 어제 수석비서관 및 보좌관 회의에서 "그동안 남북관계는 적대적 과거가 있었던 것은 사실이지만, 지금은 서로 화해와 협력을 위해 대화하는 상황인데 인공기와 김정일 위원장 초상화를 불태우는 것은 적절치 않다고 생각한다. 유감스러운 일이다"라고 밝힌바 있다.