특히 행정도시내 복합캠퍼스를 추진했던 충남대와 공주대, 한밭대, 한남대 쪽의 반발이 거세다.

충남대는 21일 '행정도시 입지 관련 충남대 입장'이라는 보도자료를 통해 "수도권 사립대만의 대학설치는 지역 국립대의 무력화를 초래할 것"이라며 "국립대학이 행복도시에 설치될 수 있도록 교육부와 지속적인 협의를 추진해 나가기로 의견을 모았다"고 밝혔다.

충남대 교수회도 같은날 성명을 통해 "행정복합도시 내 국립대 설치가 불가능하다는 교육부의 결정과 행정도시건설청의 통보는 어불성설"이라며 "이러한 교육부의 결정과 행정도시건설청의 통보는 시정돼야 한다"고 목소리를 높였다.

공주대도 21일 오전과 오후 계속해서 교무회의를 여는 등 향후 대책에 골몰하는 모습이다.

이화룡 공주대 혁신본부장은 "교육부가 예산문제 등을 이유로 국립대를 배재했다고 하는데 4개 대학이 복합캠퍼스 추진계획을 만들면서 합의한 것이 국고에 의지하지 말자는 것이었다"며 "각 대학이 가진 자산이나 기성회비, 쓰지 않는 캠퍼스 부지 매각 등을 통해 국가재정에 부담이 되지 않기로 했는데 이러한 결정을 내린 것은 말이 되느냐"며 불만을 나타냈다. 이 본부장은 "공주대는 3개 대학과 함께 교육부의 이번 결정에 시정을 촉구하는 등 강력하게 대응하기로 했다"고 밝혔다.

4개 대학 중 유일한 사립대인 한남대도 "행정도시 건설의 기본 취지인 지역균형 발전에도 어긋나는 결정"이라고 반발하고 있다.

이은구 한남대 기획처장은 "지역균형 발전을 위해 행정도시를 만들어 놓고, 국립대를 배재한다면 서울의 유명 사립대가 들어온다는 얘기 아니냐"며 "서울의 메이저 대학이 서울을 매개로 발전했다면 대전충남의 대학들도 행정도시를 매개로 명문대로 성장할 수 있는 기회가 주어져야 한다"고 주장했다.

그는 "서울의 유명 사립대가 내려 오더라도 본부가 내려와 지역발전을 견인한다면 찬성할 수도 있을것"이라며 "그러나 제2캠퍼스나 분교 형태로 내려올 것이 분명하고 이는 사립대의 문어발식 경영이 될 것이며 지역 사립대와의 과도한 경쟁만 초래할 것"이라고 말했다.

특히 이 지역의 대학관계자는 "이 지역 국립대를 배제시켜 특정 유명 사립대에 특혜를 주려는 것 아니냐는 얘기가 돌 정도로 여론이 안 좋다"고 전했다.