감사원 감사 결과에 대해 한나라당은 "하필이면 왜 6월 국회에 발표하나"고 불만을 토로했다. 한나라당은 이미 사학법 재개정을 타법률안과 연계하겠다고 공언한 바 있다.

한국교원단체총연합회(회장 윤종건)도 이날 오후 '감사원의 사립학교 감사결과 중간발표에 대한 입장'이라는 자료를 발표, 감사원의 이날 발표와 관련한 정치적 의혹에 힘을 실었다.

한나라당 진수희 공보담당 원내부대표는 국회에서 브리핑을 통해 "감사원 발표가 의도를 의심하기에 충분한 시점에서 이뤄진 데 대해 유감을 표시하지 않을 수 없다"면서 "6월 임시국회에서 사학법 재개정이 가장 쟁점인데 감사결과를 발표하는 것은 의도를 의심하기에 충분하다"고 말했다.

같은당 교육위원인 주호영 의원도 "사학 비리가 많다면 지금까지는 한번도 감사를 안하다가 왜 지금에서야 하느냐"면서 "감사원이 말로만 독립적으로 한다고 했지, 언제 독립적으로 감사를 한 적이 있느냐"고 언성을 높였다.

이정현 부대변인은 논평을 통해 "여당의 국회전략에 필요한 시점에 후원하듯 날을 잡아 감사 결과를 발표한 것을 이해할 수 없다"면서 "특별감사까지 해서 밝힌 사학비리가 이런 정도라면, 한나라당이 제안한 방안으로도 충분히 사학비리를 척결할 수 있다"고 주장했다.

민주당 이상열 대변인은 "감사결과에 나타난 사학비리는 당연히 바로 잡아야 하고 제도적으로 보완해서 그런 비리가 생기지 않도록 해야 하지만 정치권이 감사 결과를 사학법 재개정 문제 등에 바로 연결시키는 일이 있어서는 안된다"고 말했다.

교총은 '감사원의 사립학교 감사결과 중간발표에 대한 입장'이라는 자료를 내놓았다.

교총은 자료에서 "감사원의 이번 감사는 작년말 사학의 자율성을 크게 위축하면서 공공성에만 치우친 사립학교법 개정안이 국회에서 날치기 통과된데 대한 후유증을 여론에 호소하고, 일부 지역의 사립학교 신입생 배정 거부 추진 등 사학법인의 집단적 반발을 무마하기 위한 표적감사였다"고 비난했다.

이어 "감사원의 이번 조사가 일부 사학의 부조리 들춰내기에 집중하면서 재발 방지를 위한 효과적 조치를 제시하지 못했다"며 "감사원의 이날 발표가 진행중인 사학법 재개정에 걸림돌이 돼서는 안된다"고 강조했다.

반면, 열린우리당 우상호 대변인은 "감사결과 일부 사학이 여러 유형의 비리를 저지른 것으로 드러나 참으로 유감스럽고 충격적"이라며 "이번 감사결과는 투명한 사학 운영을 위해 개방형 이사제가 필요함을 다시 한번 확인시켜줬다"고 논평했다.