김 부총리는 1차 BK21 수행기관인 국민대가 2차사업에서 배제된 것과 관련한 열린우리당 김영춘 의원의 질의에 대해 "대학은 BK21을 반드시 따와야한다고 하지만 교수는 다른 연구를 못하기 때문에 BK21를 피한다"고 밝혔다.

김 의원은 특히 "김 부총리가 수주받은 성북구청 프로젝트 발주규모가 성북구 재정자립도를 감안했을 때 이례적으로 크다"며 "학위를 매개로 수주받은 것은 아니라 할 지라도 인지상정으로 봤을 때 매끄럽지는 못하다"고 덧붙였다.

이에 대해 김 부총리는 "인구 규모가 비슷한 포항시로부터 발주 받은 프로젝트는 1억7,000만원, 강남구가 발주한 프로젝트는 2억7,500만원에 달한다"며 김 의원의 주장에 반박했다.